La sphère universitaire présente sur le territoire de l’agglomération fait la part belle à la recherche et à l’innovation. Plusieurs établissements d’enseignement supérieur sont particulièrement engagés dans cette dynamique avec la création d’unités de recherche (sortes d’écosystèmes en faveur de l’innovation) favorisant les synergies entre les acteurs scientifiques, universitaires et socio-économiques du territoire et les partenariats avec d’autres unités de recherche au niveau national et international.
L’Université Bretagne Sud (UBS) est particulièrement engagée dans cette voie puisqu’elle abrite 14 laboratoires de recherche, dont 9 fortement implantés sur Vannes. Ceux-ci réunissent plus de 250 enseignants-chercheurs dans les domaines de la psychologie, du droit, des sciences de l’information, des mathématiques ou encore de la géo-architecture, et plus de 200 doctorants.
L’Université Catholique de l’Ouest (UCO) Vannes Bretagne-Sud possède également un pôle Recherche actif composé d’une quinzaine d’enseignants-chercheurs qui mènent des travaux de recherche dans des disciplines variées telles que la musicologie, le droit et l’économie, l’histoire, les sciences de l’éducation…